Vyhodnotenie plnenia programu biopalív v roku 2009 a v 1. štvrťroku 2010 podľa Ministerstva hospodárstva a výstavby (MHV) SR totiž ukázalo, že cieľovú hodnotu 5,75 % energetického obsahu stanovenú pôvodne na rok 2010 je možné splniť len za predpokladu zvýšenia ceny automobilových benzínov o 2,82 eurocenta na liter a zvýšením ceny motorovej nafty o 1,62 eurocenta na liter pre konečných spotrebiteľov.
Dosah na cenu paliva vyplýva z titulu zdanenia prevyšujúceho obsah biodieselu / metylesteru repky olejnej (MERO) v motorovej nafte oslobodeného od spotrebnej dane (5 % objemových) sadzbou dane pre motorovú naftu na úrovni 368 eur/1000 litrov.
Úpravu referenčnej hodnoty biozložiek v pohonných látkach odporučilo Generálne riaditeľstvo pre energetiku a dopravu Európskej komisie ešte vo februári 2010. Referenčná hodnota pre rok 2009 predstavovala 3,4 %.
SR sa na základe hodnotenia v roku 2008 nachádzala podľa energetického obsahu biopalív na celkovom množstve motorových palív uvedených na trh na 8. mieste spomedzi 27 členských krajín EÚ.